Według NIK pozyskiwanie budynków na siedziby ARiMR miało charakter doraźny i było prowadzone przewlekle. Dochodziło też do naruszeń ustwawy o zamówieniach publicznych.
_ Agencja Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa zatrudnia około 9 tysięcy pracowników i pełni istotną rolę w obiegu środków unijnych. _ Wiceprezes Izby Jacek Jezierski poinformował, że próby wyboru tymczasowej siedziby Agencji w Warszawie przy ulicy Żelaznej okazały się nietrafne i naraziły Agencję na dodatkowe koszty w wysokości 3 milionów złotych. Jeszcze gorzej, według NIK, przedstawia się sytuacja w biurach regionalnych i powiatowych.
W okresie od stycznia 2002 do marca 2006, koszty związane z wynajmem, remontami i adaptacją pomieszczeń dla poszczególnych biur tej agencji wyniosły 262 miliony złotych.
Do zarzutów NIK odniósł się wicepremier Andrzej Lepper powiedział, że agencja cały czas przejmuje nowe obowiązki i zatrudnia nowych ludzi dlatego potrzebuje coraz większej powierzchni biurowej.