Głównym akcjonariuszem Alior Banku jest PZU. PZU ma 25,19 proc. akcji banku, PZU Życie oraz TFI PZU mają 4,03 proc. udziału w kapitale zakładowym tego banku.
Na początku listopada 2016 r. nastąpiło prawne połączenie Alior Banku z wydzieloną częścią Banku BPH, obejmującą jego podstawową działalność, bez portfela kredytów hipotecznych i BPH TFI. Po tym połączeniu, Alior Bank awansował na 9. pozycję wśród największych banków w Polsce pod względem wartości aktywów (62 mld zł) i 6. miejsce pod względem liczby klientów (4,2 mln).
W grudniu 2016 roku PZU w konsorcjum z PFR podpisało z UniCredit umowę ws. kupna 32,8 proc. akcji Pekao SA, za 10,6 mld zł. PZU zapowiadał, że nie zamierza łączyć Banku Pekao i Alior Banku.