Po śmierci papieża Jana Pawła Drugiego utracili swe urzędy szefowie wszystkich kongregacji i komisji. Taki los spotkał stojącego na czele watykańskiego ministerstwa oświaty kardynała Zenona Grocholewskiego. Sytuacja pozostałych - arcybiskupów, biskupów i prałatów nie zmieniła się. Ku zaskoczeniu obserwatorów, dotyczy to również sekretarza Jana Pawła Drugiego.
Arcybiskup Stanisław Dziwisz musiał opuścić papieski apartament, który zgodnie z przepisami został zaplombowany do wyboru jego następcy. Jednak kiedy 19 marca 1998 roku papież podniósł go do godności biskupiej mianował go także dodatkowym prefektem tzw. Domu Papieskiego - urzędu organizującego jego audiencje i spotkania. Arcybiskup Dziwisz pozostał na tym stanowisku.
O życzliwości, jaką ma dla niego Benedykt XVI, świadczy fakt zaproszenia go na wczorajszą mszę w Kaplicy Sykstyńskiej. Według obowiązujących zasad, nowowybrany papież odprawia mszę wyłącznie z udziałem kardynałów, którzy uczestniczyli w konklawe.
